生物医学基础科研实用数据库汇总 - 2017白菜网送彩金验证手机

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发布时间:2018-08-09 15:47

今天把最常用的一些的实用数据库汇总整理了一下:

基因表达数据集 

GEO

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds/

ArrayExpress

https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/

TCGA

https://cancergenome.nih.gov/


miRNA分析预测

starBase Starbase重新上线,广大科研汪的福音来了!

https://starbase.sysu.edu.cn/

miRTarBase

http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/php/index.php

miRWalk

http://mirwalk.umm.uni-heidelberg.de/

miRBase

http://www.mirbase.org/

TargetScan

http://www.targetscan.org/

DIANA 我好像发现了一个miRNA各种软件的大本营……如果miRNA神器只能推荐一个,就是这个了!

http://diana.imis.athena-innovation.gr/

mirDIP 不吹不黑,这个数据库真心好用!

http://ophid.utoronto.ca/mirDIP/


基因信息 

GeneCards 准备国自然基金,这两个数据库好用到爆!

https://www.genecards.org/

BioGPS

http://biogps.org/

UCSC 这是一个神奇的网站:UCSC Genome Brower

http://genome.ucsc.edu/


转录因子、启动子、泛素化修饰 

iregulon 转录调控一站式工具——iRegulon

http://iregulon.aertslab.org/

TFcheckpoint

http://www.tfcheckpoint.org/

Promoter

http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/

UbiBrowser 高大上的研究怎能少了此等神器?

http://ubibrowser.ncpsb.org/


lncRNA 

DIANA 我好像发现了一个miRNA各种软件的大本营……如果miRNA神器只能推荐一个,就是这个了!

http://diana.imis.athena-innovation.gr/

StarBase Starbase重新上线,广大科研汪的福音来了!

https://starbase.sysu.edu.cn/


circRNA 

circBase

http://www.circbase.org/

StarBase Starbase重新上线,广大科研汪的福音来了!

https://starbase.sysu.edu.cn/ 


基因功能分析

DAVID

https://david.ncifcrf.gov/

Metascape 超好用的基因功能分析网站!

http://metascape.org/ 

XTalkDB 在信号通路中迷了路?

http://www.xtalkdb.org/


蛋白质互作  

STRING

https://string-db.org/)

MINT

https://mint.bio.uniroma2.it/

BioGrid 

https://thebiogrid.org/

GeNets 换种姿势做PPI分析

http://apps.broadinstitute.org/genets#


TCGA数据库分析 

GEPIA

http://gepia.cancer-pku.cn/

cbioportal

www.cbioportal.org/

Oncomine 如何从Oncomine找到可以直接放到文章里面的结果?

https://www.oncomine.org/

UALCAN

http://ualcan.path.uab.edu/index.html

Kaplan Meier Plotter TCGA数据库挖掘分析,这个网站好用到爆!

http://kmplot.com/analysis/ 

LinkedOmics 分析TCGA数据库的工具这么多,我就只服这一个!

http://www.linkedomics.org/


药物相关  

L1000FWD 又全又好用的药物数据库看过来!

http://amp.pharm.mssm.edu/L1000FWD/)

[email protected]

http://tcm.cmu.edu.tw/

TCMGeneDIT

http://tcm.lifescience.ntu.edu.tw/

TCMID 中药研究,这些数据库能帮你拿到基金!

http://www.megabionet.org/tcmid/


疾病相关 

MalaCards

http://www.malacards.org/

Lncrnadisease 疾病研究找不到方向怎么办?

http://www.cuilab.cn/lncrnadisease 

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